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在观察蛇颈龟时,我们可通过体型差异轻松辨别雌雄。雌性蛇颈龟体型较为魁梧,一般体重介于1.75至3千克,背甲长度在20至25厘米,尾巴较短,泄殖腔孔隐藏于腹甲后部边缘之内。而雄性蛇颈龟体型相对娇小,体重通常在0.7至0.9千克,背甲长度约在16至20厘米,尾巴较长,泄殖腔孔则位于腹甲后部边缘之外。
成年蛇颈龟的背甲长度多在12至30厘米之间,头部扁平且宽阔,颈部特别长,其长度大约是背甲长度的0.8倍,且左右弯曲灵活,极具特色。
蛇颈龟的背甲颜色为棕褐色,呈长椭圆形或卵圆形,前端较小,前后缘盾无锯齿状,腹甲为黄色,较长且窄,表面无任何斑点。头部较扁平,喙部呈流线型,无锯齿,颈部较长,长度几乎与背甲相等。